54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  100 
 
 		 194 aa  373  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  61.18 
 
 		 185 aa  208  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  29.66 
 
 		 548 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  43.21 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  32.65 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  32.65 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  25.86 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  30.41 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  26.92 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  26.92 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  36.28 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  23.46 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 145 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  43.33 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 149 aa  48.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  48.33 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  39.13 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 188 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  26.61 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  25.53 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 142 aa  42  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 149 aa  41.2  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>