43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1980 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  100 
 
 
194 aa  401  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  65.76 
 
 
196 aa  261  6e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
185 aa  190  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  46.28 
 
 
188 aa  171  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  45.5 
 
 
186 aa  171  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  37.22 
 
 
185 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  33.33 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  33.33 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  30 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  29.78 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  30.64 
 
 
548 aa  55.8  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  27.92 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  34.68 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  30.27 
 
 
181 aa  52  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  24.47 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
356 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
196 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  34 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
143 aa  45.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  33.62 
 
 
343 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  30.22 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  25.77 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
198 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 
583 aa  41.6  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>