83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8348 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  358  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  74.85 
 
 
188 aa  246  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  60.87 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  58.1 
 
 
196 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  59.65 
 
 
185 aa  184  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  52.35 
 
 
181 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  48.88 
 
 
179 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 
181 aa  151  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  50 
 
 
170 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 
188 aa  143  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  46.78 
 
 
190 aa  141  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 
187 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  42.6 
 
 
199 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  42.13 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 
185 aa  110  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 
204 aa  96.3  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  41.28 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  41.28 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
197 aa  87.8  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  41.76 
 
 
181 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  37.78 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 
198 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  27.12 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
205 aa  58.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
141 aa  55.1  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
194 aa  54.3  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 
185 aa  54.3  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  32 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  26.38 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
144 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
142 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  27.16 
 
 
196 aa  52  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 
283 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  26.22 
 
 
186 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
148 aa  51.6  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 
145 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
252 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
191 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  39.13 
 
 
194 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  28.91 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
542 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
252 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  26.52 
 
 
548 aa  45.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
141 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  30.16 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
154 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  46 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
154 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 
146 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  28.57 
 
 
152 aa  42.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
160 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
303 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
153 aa  42  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  28.22 
 
 
159 aa  41.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  25.19 
 
 
149 aa  41.2  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  26.05 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  24.29 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  40 
 
 
149 aa  40.8  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>