102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2862 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
191 aa  121  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  35 
 
 
145 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
141 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 
147 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
145 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
141 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
146 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 
186 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  31.09 
 
 
181 aa  52.4  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
536 aa  52.4  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  36 
 
 
144 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
187 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  28.97 
 
 
142 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
190 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
149 aa  48.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  39.76 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
149 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
142 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  29.91 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
133 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
141 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  33.12 
 
 
181 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
160 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  51.72 
 
 
132 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
319 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  36.11 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  45.45 
 
 
181 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  24.79 
 
 
149 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  27.48 
 
 
149 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  22.54 
 
 
548 aa  45.4  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  28.66 
 
 
343 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 
181 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  29.27 
 
 
289 aa  45.1  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
179 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
136 aa  45.1  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  34.83 
 
 
303 aa  45.1  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  24.79 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  25.81 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  30.06 
 
 
352 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  31.39 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  25.6 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  23.97 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  24.79 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  44 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  24.79 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  23.97 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.3 
 
 
131 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0082  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 
291 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  24.26 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
326 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  26.39 
 
 
363 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  40 
 
 
162 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  28.83 
 
 
352 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 
171 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
148 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  25 
 
 
140 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1697  NUDIX family hydrolase  34.48 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
132 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
286 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 
137 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  42.62 
 
 
142 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  30.63 
 
 
329 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02760  conserved hypothetical protein  40.85 
 
 
248 aa  42.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  42.86 
 
 
137 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 
319 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  42.62 
 
 
137 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
164 aa  42.4  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  45 
 
 
132 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  45 
 
 
132 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
179 aa  42  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
169 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 
140 aa  42  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 
201 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.95 
 
 
360 aa  42  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  25.58 
 
 
179 aa  42  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
154 aa  42  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
156 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4880  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
117 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
174 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
148 aa  42  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  40.98 
 
 
138 aa  41.6  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  35 
 
 
153 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  40.98 
 
 
138 aa  41.6  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  19.66 
 
 
185 aa  41.6  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  44.83 
 
 
134 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  41.67 
 
 
138 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
168 aa  41.6  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  31.9 
 
 
386 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
166 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
157 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  43.33 
 
 
170 aa  41.2  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>