87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2189 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  100 
 
 
201 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  40 
 
 
149 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
139 aa  101  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
141 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
170 aa  99.4  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 
141 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
138 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
166 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  40.62 
 
 
166 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
138 aa  92  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
127 aa  90.1  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
161 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
155 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  40.8 
 
 
134 aa  90.1  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 
156 aa  89.4  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
156 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
165 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
162 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  37.4 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
176 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  42.06 
 
 
390 aa  85.5  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 
176 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  38.93 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  36.64 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 
153 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  36.94 
 
 
151 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
137 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
163 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  35.04 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  38.58 
 
 
159 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
152 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  32.58 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  39.23 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
464 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
246 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  32.89 
 
 
170 aa  62  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
177 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
158 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  29.6 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  30.58 
 
 
159 aa  53.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  24.84 
 
 
155 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 
183 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  48.5  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
141 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  35 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
140 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
140 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
141 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
141 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
141 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
146 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  31.3 
 
 
314 aa  45.1  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  29.8 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
536 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  31.82 
 
 
142 aa  43.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  45 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  45 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  25 
 
 
548 aa  42.7  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
149 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
153 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  34 
 
 
149 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 
210 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
139 aa  42  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  28.81 
 
 
475 aa  41.6  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 
150 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
141 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
151 aa  41.6  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.32 
 
 
132 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>