47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0662 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  96.2 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  46.28 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  48.11 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  42.94 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  29.19 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  29.19 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  30.81 
 
 		 548 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  26.49 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  25.15 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  26.58 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  25.87 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  26.24 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  26.92 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  26.38 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 283 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  21.69 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  25.15 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  23.72 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  19.75 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  24.55 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  19.11 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  22.29 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  20.12 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  34.67 
 
 		 343 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  21.47 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  20.69 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  24.26 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  27.96 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  24.34 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  22.9 
 
 		 351 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  25.95 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  24.83 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 356 aa  42  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  23.28 
 
 		 152 aa  42  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  20 
 
 		 473 aa  41.2  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>