47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22390 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 196 aa  406  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  65.76 
 
 		 194 aa  261  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  48.11 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  47.57 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  38.07 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  36.36 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  36.36 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  28.32 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  25.19 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  30.41 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  27.16 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  31.13 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  27.33 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  26.92 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  27.89 
 
 		 356 aa  48.9  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 142 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  24.26 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  27.13 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  35.44 
 
 		 343 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 324 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  26.38 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 351 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 341 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 		 336 aa  42.4  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 163 aa  42  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  28.69 
 
 		 150 aa  42  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 144 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 177 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  24.83 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>