49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2393 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  49.72 
 
 		 178 aa  184  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  47.77 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  46.7 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  50.31 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  50.31 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  49.42 
 
 		 204 aa  144  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  47.29 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  51.91 
 
 		 195 aa  124  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  49.61 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  47.75 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  39.44 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  38.93 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  31.79 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  28.66 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  28.66 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  37.42 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  31.47 
 
 		 548 aa  72  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 		 283 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  36.2 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 205 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 154 aa  48.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  24.28 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>