56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2957 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  100 
 
 
188 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  74.55 
 
 
181 aa  244  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  59.43 
 
 
196 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  59.17 
 
 
171 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  60.23 
 
 
185 aa  191  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
188 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  49.43 
 
 
179 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  48.02 
 
 
181 aa  147  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  49.39 
 
 
170 aa  142  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  47.67 
 
 
190 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  47.34 
 
 
199 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  47.9 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
199 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  45.25 
 
 
184 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  45.25 
 
 
184 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  45.25 
 
 
184 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
204 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 
185 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  42.95 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  42.95 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  43.42 
 
 
181 aa  87.8  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  41.01 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  27.67 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  24.29 
 
 
548 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  25.15 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  26.06 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
163 aa  52  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  25.15 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  27.04 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  29 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
283 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 
191 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  26.45 
 
 
196 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
252 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  27.7 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
542 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
145 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  41.38 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
163 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  24.41 
 
 
160 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
145 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  52.78 
 
 
239 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>