56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4177 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 170 aa  335  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  66.47 
 
 		 181 aa  217  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  68.07 
 
 		 181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  60.84 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  61.94 
 
 		 190 aa  187  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  56.32 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  56.63 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  56.63 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  56.63 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  52.12 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  50.89 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  49.69 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 188 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  51.53 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  49.08 
 
 		 199 aa  140  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  49.69 
 
 		 188 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  44.52 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  47.37 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 		 204 aa  93.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  42 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  42 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  36.11 
 
 		 215 aa  70.9  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  39.02 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  28.7 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  25.26 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  41.27 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  27.08 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  27.66 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  27.66 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  25.37 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 139 aa  42  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  26.95 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  35.05 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  26.95 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>