26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0841 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  100 
 
 
201 aa  397  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3885  hypothetical protein  58.56 
 
 
192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 
187 aa  118  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
283 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  27.65 
 
 
548 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
190 aa  54.7  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  34.69 
 
 
185 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
170 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  25.87 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  28.68 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 
204 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  24.49 
 
 
184 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
199 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  30.17 
 
 
215 aa  41.2  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
185 aa  41.2  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>