63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3304 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 187 aa  370  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  62.57 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  61.4 
 
 		 190 aa  205  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  57.69 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  59.22 
 
 		 181 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  54.79 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  59.65 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  59.65 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  59.65 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  56.32 
 
 		 170 aa  179  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  48.07 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  50.6 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  49.68 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  47.9 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  43.71 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  40.88 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  35.25 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  36.24 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  36.24 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  48.28 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 283 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  35.71 
 
 		 548 aa  50.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  49.23 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  21.84 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  19.46 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 252 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  28.28 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  26.14 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  31.39 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  30.37 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 145 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1309  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 122 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.62 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  29.76 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>