More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0677 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  84.83 
 
 		 145 aa  254  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  49.33 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0082  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1990  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  35.81 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  34.09 
 
 		 548 aa  57.8  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  35.77 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  46.67 
 
 		 536 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  54.35 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  35.9 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  36.21 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  26.98 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  26.98 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  48 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  54.76 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  30.28 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 		 216 aa  48.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.77 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  32.82 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2861  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  28.28 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4880  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.9 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  36.11 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2538  hypothetical protein  37.5 
 
 		 323 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  35.34 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  54.35 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1856  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015208  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  34.45 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  26.61 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  29.91 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>