More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1932 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  100 
 
 
221 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  95.39 
 
 
221 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  77.73 
 
 
221 aa  336  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9419  hypothetical protein  61.32 
 
 
361 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2736  ADP-ribose pyrophosphatase  35.37 
 
 
300 aa  94.7  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000235258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0866  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
274 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0186051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6422  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  35.71 
 
 
342 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.58 
 
 
362 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.09 
 
 
349 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.09 
 
 
355 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.17 
 
 
159 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
156 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.84 
 
 
158 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  56.6 
 
 
148 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  35.82 
 
 
358 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 
142 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  58 
 
 
136 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
346 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.07 
 
 
345 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.45 
 
 
338 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
148 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 
197 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 
148 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  67.57 
 
 
209 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
165 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.59 
 
 
346 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  52 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.59 
 
 
346 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.45 
 
 
346 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.45 
 
 
346 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  28.17 
 
 
548 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.59 
 
 
346 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  50 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  45.61 
 
 
146 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
155 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  49.18 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  52 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  28.28 
 
 
152 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 
147 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
154 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  50 
 
 
132 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.5 
 
 
345 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
143 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  50 
 
 
162 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
145 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
133 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  58.14 
 
 
154 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  64.29 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  42 
 
 
147 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
152 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  41.51 
 
 
147 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  41.51 
 
 
147 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
153 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  37.84 
 
 
164 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
143 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
143 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  41.51 
 
 
147 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  39.76 
 
 
167 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  59.52 
 
 
153 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  37.14 
 
 
355 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  56.1 
 
 
157 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  27.59 
 
 
154 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  44.29 
 
 
163 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
149 aa  49.3  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  42 
 
 
147 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 
161 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 
165 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
147 aa  48.9  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  39.73 
 
 
158 aa  48.9  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
152 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  55.22 
 
 
173 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  50 
 
 
160 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 
525 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  36.49 
 
 
146 aa  48.5  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
158 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  31.93 
 
 
137 aa  48.5  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  60.53 
 
 
128 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
174 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  31.18 
 
 
154 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
174 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
155 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
155 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
174 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
155 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
132 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  50 
 
 
162 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  28.28 
 
 
154 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.83 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  46.77 
 
 
160 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  46.77 
 
 
160 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  42 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 
166 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
152 aa  47.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
155 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>