75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6422 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6422  NUDIX hydrolase  100 
 
 
408 aa  820    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9419  hypothetical protein  37.38 
 
 
361 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2736  ADP-ribose pyrophosphatase  34.67 
 
 
300 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000235258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
221 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
221 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0866  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0186051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5022  hypothetical protein  37.37 
 
 
149 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
152 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  40.96 
 
 
314 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  42.86 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
139 aa  49.7  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  27.52 
 
 
153 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  30 
 
 
153 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  24.65 
 
 
171 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  23.94 
 
 
171 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  31.43 
 
 
313 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
167 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
167 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
171 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
134 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
153 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  28.57 
 
 
153 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
153 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
149 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  25.86 
 
 
173 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
153 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  28.57 
 
 
153 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  32.94 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 
159 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
153 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
153 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 
132 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  40.35 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
141 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
162 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 
158 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26230  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  46.55 
 
 
211 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
150 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 
164 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  41.82 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  26.61 
 
 
229 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  32.94 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  26.19 
 
 
160 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
161 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  41.82 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  37.84 
 
 
144 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
163 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
155 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
161 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  33.78 
 
 
316 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
142 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  30.1 
 
 
146 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
158 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
167 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
191 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
158 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  43.1 
 
 
173 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
172 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 
155 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 
153 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.74 
 
 
138 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  30.59 
 
 
314 aa  43.1  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.74 
 
 
138 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 
158 aa  43.1  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  43.18 
 
 
136 aa  43.1  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  32.94 
 
 
315 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
187 aa  43.1  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
144 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  32.94 
 
 
315 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
225 aa  43.1  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>