276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26230 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26230  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
211 aa  436  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0389  NUDIX hydrolase  52.28 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01790  NTP pyrophosphohydrolase  45.54 
 
 
274 aa  178  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301354 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1862  MutT/NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2150  NUDIX family hydrolase  32.79 
 
 
184 aa  85.1  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  33.6 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  34.4 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  32 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07711  MutT/nudix family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08240)  29.35 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  32 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  32 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  32.48 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  31.2 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1768  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00835912  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38092  predicted protein  28.65 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00931034  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  31.5 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.5 
 
 
176 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
179 aa  62  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
184 aa  62  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  30.4 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  32.03 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  32.03 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  32.03 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.4 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  30.4 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  32.03 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  32.03 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  32.03 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0696  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
184 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.257627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.4 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.4 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.4 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  32.03 
 
 
179 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.4 
 
 
196 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05950  phosphoribosyl-ATP diphosphatase, putative  26.4 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 
177 aa  58.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  32.03 
 
 
179 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0967  ADP-ribose pyrophosphatase  33.83 
 
 
183 aa  58.2  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.6 
 
 
196 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  32.03 
 
 
179 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  29.6 
 
 
194 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04580  nudix hydrolase family protein  33.59 
 
 
183 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3451  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.824912  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  25.15 
 
 
182 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0849  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 
176 aa  56.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1402  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
181 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173305  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  25.37 
 
 
166 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  33.71 
 
 
171 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
191 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 
177 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
173 aa  54.7  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
181 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  32.95 
 
 
185 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
184 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3598  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>