More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0696 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0696  NUDIX hydrolase  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.257627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04580  nudix hydrolase family protein  80.11 
 
 
183 aa  301  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0967  ADP-ribose pyrophosphatase  73.48 
 
 
183 aa  281  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0849  NUDIX hydrolase  72.93 
 
 
183 aa  280  9e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0001  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
186 aa  143  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3451  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.824912  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0876  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0374546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
178 aa  82  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  37.19 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  37.4 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  37.4 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  37.4 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  37.4 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  37.4 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  37.4 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  37.4 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  39.6 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  37.4 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  38.21 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0988  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  28.22 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  33.1 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  33.1 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1460  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
177 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
199 aa  62  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26230  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  34.4 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
199 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1862  MutT/NUDIX family hydrolase  35.77 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168292  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38092  predicted protein  34.81 
 
 
212 aa  58.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00931034  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 
193 aa  58.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  33.12 
 
 
202 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
204 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0995  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
170 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.575894  normal  0.946338 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07711  MutT/nudix family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08240)  30.86 
 
 
207 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
281 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  33.72 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  30.87 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0092  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
196 aa  55.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
196 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  35 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 
193 aa  55.1  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
171 aa  54.7  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 
211 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3582  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.77 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2150  NUDIX family hydrolase  34.96 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290696  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.77 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.77 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.77 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  30.99 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  31.08 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29 
 
 
206 aa  52.4  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>