More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0876 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0876  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0374546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3451  NUDIX hydrolase  68.64 
 
 		 173 aa  224  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.824912  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0988  NUDIX hydrolase  58.29 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0001  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0696  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.257627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04580  nudix hydrolase family protein  39.63 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0849  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0967  ADP-ribose pyrophosphatase  37.89 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  32.78 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  46.53 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  45.54 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  34.07 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 201 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  40.62 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  35.77 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1460  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  34.21 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  36.97 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  35.54 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  35.54 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  35.54 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  35.54 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  35.54 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  35.54 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  35.54 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  39.06 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  35.25 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 281 aa  64.7  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  35.25 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  31.33 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  33.58 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  35.77 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  35.04 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  39.17 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.89 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.8 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  33.82 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  45.56 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  39.13 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>