235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04580 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04580  nudix hydrolase family protein  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0696  NUDIX hydrolase  80.11 
 
 
184 aa  301  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.257627 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0967  ADP-ribose pyrophosphatase  72.93 
 
 
183 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0849  NUDIX hydrolase  72.38 
 
 
183 aa  281  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0001  NUDIX hydrolase  44.69 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3451  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.824912  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0876  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0374546  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0988  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36.91 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  33.11 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  32.41 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1460  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  36.28 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36.28 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  36.28 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  36.28 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36.28 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  37.74 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  36.28 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  36.28 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.72 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36.28 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26230  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  33.59 
 
 
211 aa  58.2  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
179 aa  54.7  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  36.96 
 
 
187 aa  54.7  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38092  predicted protein  33.09 
 
 
212 aa  54.3  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00931034  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0092  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  26.17 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
228 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1862  MutT/NUDIX family hydrolase  30.89 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
211 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  31.91 
 
 
194 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
225 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  38.05 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
178 aa  51.2  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
196 aa  51.2  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
164 aa  51.2  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07711  MutT/nudix family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08240)  26.86 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  42.27 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2150  NUDIX family hydrolase  36.26 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  34.91 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
210 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  31.97 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
215 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
281 aa  50.1  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3582  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  35.04 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
208 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
180 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
171 aa  48.5  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
196 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 
187 aa  48.5  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>