More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1862 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1862  MutT/NUDIX family hydrolase  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2150  NUDIX family hydrolase  97.28 
 
 
184 aa  335  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26230  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  32.97 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01790  NTP pyrophosphohydrolase  40.6 
 
 
274 aa  94  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  38.1 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36.64 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  34.56 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38092  predicted protein  33.33 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00931034  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0389  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1768  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00835912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0967  ADP-ribose pyrophosphatase  35.2 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0696  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.257627 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1402  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1460  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0849  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53805  predicted protein  35.65 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.984982 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05950  phosphoribosyl-ATP diphosphatase, putative  35.78 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36.57 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  36.57 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  36.57 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  36.57 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36.57 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  36.57 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  33.14 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.17 
 
 
204 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.15 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  39.5 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  33.6 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36.57 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  31.54 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3582  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
205 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.29 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  31.25 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  38.18 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  39.83 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.75 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.73 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
187 aa  62  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1625  uridine diphosphate glucose pyrophosphatase  31.08 
 
 
196 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
201 aa  61.6  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 
204 aa  61.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0736  NTP pyrophosphohydrolase including oxidative damage repair enzyme  30 
 
 
224 aa  61.2  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 
169 aa  61.2  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  32 
 
 
176 aa  61.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
220 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1592  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  30.43 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  30 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.04 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.04 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  36.04 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  30.23 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.58 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
281 aa  60.5  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  43.04 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.13 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.33 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  36.94 
 
 
335 aa  59.7  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.37 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  26.97 
 
 
172 aa  58.9  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
208 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.96 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04580  nudix hydrolase family protein  30.89 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
225 aa  58.5  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  33.9 
 
 
210 aa  58.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>