More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0967 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0967  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0849  NUDIX hydrolase  98.36 
 
 
183 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04580  nudix hydrolase family protein  72.93 
 
 
183 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0696  NUDIX hydrolase  73.48 
 
 
184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.257627 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0001  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 
186 aa  137  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3451  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 
173 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.824912  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0876  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0374546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36.09 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  36.09 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  36.09 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  36.3 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36.09 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  36.09 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  36.09 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  36.09 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  41.46 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  36.36 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36.84 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  37.75 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0988  NUDIX hydrolase  46.32 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  35 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  31.51 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1862  MutT/NUDIX family hydrolase  35.2 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168292  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1460  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  40 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
163 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  30.82 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  37.74 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  32.53 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.1 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
199 aa  58.5  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0092  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
196 aa  58.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
186 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26230  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  33.83 
 
 
211 aa  58.2  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
225 aa  57.8  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 
203 aa  57.8  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 
208 aa  57.8  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
281 aa  57.4  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.89 
 
 
210 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.89 
 
 
210 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.89 
 
 
210 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.89 
 
 
210 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
193 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0995  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.575894  normal  0.946338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
201 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
194 aa  55.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2150  NUDIX family hydrolase  34.4 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.89 
 
 
210 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
208 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
228 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
171 aa  55.5  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  40 
 
 
204 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
176 aa  54.7  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
193 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.37 
 
 
209 aa  54.7  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  31.58 
 
 
209 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  31.58 
 
 
209 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  31.58 
 
 
209 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  31.58 
 
 
209 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  31.58 
 
 
209 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
188 aa  54.3  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  31.58 
 
 
209 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>