More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0988 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0988  NUDIX hydrolase  100 
 
 
182 aa  364  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3451  NUDIX hydrolase  67.24 
 
 
173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.824912  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0876  NUDIX hydrolase  58.29 
 
 
180 aa  185  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0374546  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0001  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
186 aa  119  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621893  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04580  nudix hydrolase family protein  42.31 
 
 
183 aa  117  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0696  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
184 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.257627 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0967  ADP-ribose pyrophosphatase  46.32 
 
 
183 aa  104  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0849  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
183 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  42.98 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  38.06 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  45.56 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  39.62 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  34.96 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  39.62 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  39.62 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  39.62 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  39.62 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  39.62 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  39.62 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  40.43 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  43.01 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1460  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  42.39 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  40 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  34.97 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  38.3 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  42.11 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  41.23 
 
 
210 aa  67.8  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  40.38 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  35.37 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  43.27 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  32 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
188 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  40.22 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  41.49 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  36.5 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07711  MutT/nudix family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08240)  27.89 
 
 
207 aa  62.4  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
186 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
195 aa  62  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  44.33 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 
210 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
179 aa  62  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  45 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
220 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
220 aa  60.8  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
192 aa  60.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  34.65 
 
 
176 aa  60.8  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.76 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.76 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>