More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3451 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3451  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 173 aa  342  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.824912  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0876  NUDIX hydrolase  68.64 
 
 		 180 aa  207  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0374546  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0988  NUDIX hydrolase  67.24 
 
 		 182 aa  194  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0001  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04580  nudix hydrolase family protein  39.77 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0696  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.257627 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0967  ADP-ribose pyrophosphatase  41.72 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0849  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  40.59 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  40.59 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  40.59 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  40.59 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  40.59 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  40.59 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  40.59 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  41.58 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  35.61 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1460  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  40.59 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 209 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 209 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  32.86 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  43.82 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  34.09 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  46.79 
 
 		 210 aa  70.9  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  33.08 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  38.98 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  41.76 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  34.01 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36.11 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.52 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  44.71 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.54 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  30.66 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1402  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  35.66 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  40.23 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  27.67 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  33.33 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  33.33 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0092  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.94 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.94 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  40.66 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>