More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2150 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2150  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1862  MutT/NUDIX family hydrolase  97.28 
 
 		 184 aa  335  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168292  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01790  NTP pyrophosphohydrolase  39.85 
 
 		 274 aa  95.5  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301354 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26230  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  32.79 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  38.1 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0389  NUDIX hydrolase  29.74 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  34.35 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  30.27 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38092  predicted protein  34.57 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00931034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1768  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00835912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  38.46 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1460  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3582  NUDIX hydrolase  34.08 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  35 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36.57 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  36.57 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  36.57 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36.57 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  36.57 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  36.57 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1402  NUDIX hydrolase  28.05 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  32.03 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36.57 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  39.5 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05950  phosphoribosyl-ATP diphosphatase, putative  35.78 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  39.37 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.84 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53805  predicted protein  35.65 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.984982 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1625  uridine diphosphate glucose pyrophosphatase  31.76 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2913  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.06 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  42.37 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.52 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  32.57 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.71 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1592  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0849  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  30.43 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0424  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.84 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.71 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.38 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03971  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.75 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.222226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  33.06 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 		 204 aa  60.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  28 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0967  ADP-ribose pyrophosphatase  34.4 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.38 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3598  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  36.61 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  33.09 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  36.61 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  33.08 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  36.61 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  35.96 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0696  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.257627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0736  NTP pyrophosphohydrolase including oxidative damage repair enzyme  27.66 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>