278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0736 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0736  NTP pyrophosphohydrolase including oxidative damage repair enzyme  100 
 
 
224 aa  460  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 
182 aa  72  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  34.29 
 
 
176 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  32.86 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  33.59 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  28.11 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 
184 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1697  NUDIX family hydrolase  28.8 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  25 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  25.14 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.19 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0180  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.13 
 
 
181 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3973  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.13 
 
 
181 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3734  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.13 
 
 
181 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  28.29 
 
 
176 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  26.78 
 
 
184 aa  62.8  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  25.79 
 
 
186 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4346  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.03 
 
 
181 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 
190 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 
186 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.92 
 
 
184 aa  61.6  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  27.53 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4718  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.8 
 
 
181 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
178 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  24.04 
 
 
179 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
200 aa  59.7  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1862  MutT/NUDIX family hydrolase  35.9 
 
 
184 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3890  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.05 
 
 
185 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4068  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.05 
 
 
185 aa  58.9  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
177 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0156  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.99 
 
 
184 aa  58.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00016487  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  29.74 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01790  NTP pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  23.08 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  34.02 
 
 
188 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2294  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.02 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  33 
 
 
188 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  24.59 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0190  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.99 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  24.04 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  24.04 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  24.04 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.99 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  30.56 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  24.04 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
172 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  24.04 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  24.04 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  28.9 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.43 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2150  NUDIX family hydrolase  32.08 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.48 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0164  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.48 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.43 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0169  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.48 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00239764  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.43 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.43 
 
 
183 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
180 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.05 
 
 
188 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  33 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
163 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  24.04 
 
 
179 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
164 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0331  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.99 
 
 
184 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 
179 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.99 
 
 
188 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  36.08 
 
 
188 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  36.08 
 
 
188 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 
183 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3810  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.25 
 
 
186 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.65 
 
 
188 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
169 aa  55.1  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0224  ADP-ribose diphosphatase NudE  29.63 
 
 
184 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.65 
 
 
188 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  35.71 
 
 
188 aa  55.1  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3766  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.02 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.65 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3691  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.02 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0129  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.68 
 
 
181 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.65 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3863  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.02 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4702  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.29 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.631094  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  30 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3800  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.02 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1854  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0316  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.29 
 
 
186 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3868  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.29 
 
 
186 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>