146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2736 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2736  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
300 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000235258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0866  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 
274 aa  297  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0186051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
221 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
221 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6422  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
408 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9419  hypothetical protein  41.4 
 
 
361 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  36.77 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  30.77 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
158 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
186 aa  55.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
157 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
158 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.6 
 
 
362 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
157 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
229 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.75 
 
 
159 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.37 
 
 
158 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
156 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 
155 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
151 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
151 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  28 
 
 
349 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
143 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
164 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  28 
 
 
355 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
151 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.19 
 
 
346 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
152 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  45.16 
 
 
148 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.64 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.19 
 
 
346 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.71 
 
 
346 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.19 
 
 
346 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
161 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.19 
 
 
346 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.71 
 
 
346 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
156 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.04 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
143 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
156 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
165 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
163 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  40.32 
 
 
158 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
160 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
137 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  31.13 
 
 
143 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  41.38 
 
 
530 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
229 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
153 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  30 
 
 
230 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5022  hypothetical protein  37.31 
 
 
149 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  37.97 
 
 
146 aa  45.8  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
141 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
134 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  32.94 
 
 
140 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  32.94 
 
 
149 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
132 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
155 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 
132 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  37.5 
 
 
149 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 
148 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
144 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  32.94 
 
 
149 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  32.91 
 
 
149 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
153 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  29.9 
 
 
140 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  27.37 
 
 
148 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  48.78 
 
 
163 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  37.5 
 
 
155 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  29.37 
 
 
137 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  45.45 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
132 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  46 
 
 
132 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  39.06 
 
 
142 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
132 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
169 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
161 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
163 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.51 
 
 
351 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  27.37 
 
 
148 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  29.9 
 
 
140 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  31.76 
 
 
149 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>