55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9419 on replicon NC_013596
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013596  Sros_9419  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  60.45 
 
 
221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  60.73 
 
 
221 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  59.38 
 
 
221 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2736  ADP-ribose pyrophosphatase  38.57 
 
 
300 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000235258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6422  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0866  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0186051  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  28.77 
 
 
137 aa  56.2  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.07 
 
 
345 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  33.55 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.21 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.21 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.07 
 
 
345 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.34 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.34 
 
 
346 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.34 
 
 
346 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.34 
 
 
346 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  33.33 
 
 
355 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.67 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  30.16 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
156 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  33.6 
 
 
255 aa  46.2  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.62 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
162 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
217 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  28.57 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 
153 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  29.67 
 
 
150 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
158 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  39 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
165 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.25 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
165 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
150 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5022  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3520  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
180 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  50 
 
 
162 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
248 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 
142 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.48 
 
 
159 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
142 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
229 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 
156 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
148 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 
154 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  39.66 
 
 
148 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
165 aa  43.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  43.64 
 
 
146 aa  43.1  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  56.41 
 
 
230 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  26.9 
 
 
154 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2041  8-oxo-dGTPase  40 
 
 
162 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 
156 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  55 
 
 
173 aa  42.7  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 
160 aa  42.7  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>