More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1725 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  100 
 
 
146 aa  289  8e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  68.97 
 
 
149 aa  209  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  65.77 
 
 
149 aa  204  4e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  64.08 
 
 
142 aa  182  9e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
163 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
146 aa  57  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
141 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
209 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  50 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
236 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1990  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 
536 aa  52.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  40.91 
 
 
396 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
205 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  32.38 
 
 
163 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  43.64 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  40.68 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  40.91 
 
 
373 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  30.65 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  51.61 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  42.19 
 
 
316 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  46.15 
 
 
360 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
210 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  41.38 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  40 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
221 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  40 
 
 
399 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1277  hypothetical protein  36.51 
 
 
166 aa  48.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.744115  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  46.03 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  39.66 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  46.03 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  46.03 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  46.03 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  39.66 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
542 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
216 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  38.75 
 
 
570 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  46.03 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  46.67 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
221 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.62 
 
 
349 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.42 
 
 
368 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  33.01 
 
 
167 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  40 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  52.94 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0082  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 
355 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  52.94 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  52.94 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  44.44 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 
334 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3203  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
182 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 
153 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
137 aa  47  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  37.33 
 
 
473 aa  47.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
291 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  40 
 
 
136 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  29.85 
 
 
158 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
155 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
147 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
174 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  41.38 
 
 
149 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>