More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1608 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  69.17 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 536 aa  73.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  41.96 
 
 		 424 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  35.94 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  34.81 
 
 		 308 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  42.39 
 
 		 208 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  36.96 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  41.11 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 311 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 311 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 311 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 351 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  41.43 
 
 		 258 aa  60.5  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  41.11 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.38 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 296 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  31.2 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  44.07 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 341 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  38.64 
 
 		 314 aa  53.9  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 268 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 282 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.58 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.2 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.2 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.2 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 333 aa  53.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  35.77 
 
 		 336 aa  53.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  36.36 
 
 		 317 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.58 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.19 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  35.71 
 
 		 231 aa  52.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  26.92 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.19 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  26.15 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  35.25 
 
 		 447 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 314 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.65 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 322 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 		 303 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  39.53 
 
 		 383 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.94 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.94 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>