More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0212 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 
368 aa  761    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  61.13 
 
 
396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  61.58 
 
 
434 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  57.61 
 
 
373 aa  428  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  56.78 
 
 
435 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  53.8 
 
 
360 aa  378  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  50.97 
 
 
388 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  44.6 
 
 
383 aa  292  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  41.4 
 
 
386 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 
363 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  37.43 
 
 
352 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  37.14 
 
 
352 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.71 
 
 
360 aa  259  7e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  39.01 
 
 
381 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  38.92 
 
 
360 aa  248  9e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  42.21 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 
365 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  38.9 
 
 
352 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 
365 aa  239  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 
365 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 
365 aa  239  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 
365 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 
365 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 
365 aa  238  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  43.19 
 
 
365 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 
365 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  38.15 
 
 
366 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  37.54 
 
 
350 aa  236  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 
366 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  36.72 
 
 
371 aa  232  9e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  36.97 
 
 
368 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  36.97 
 
 
368 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  36.97 
 
 
368 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  38.1 
 
 
354 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  38.1 
 
 
354 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  39.11 
 
 
368 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  39.74 
 
 
364 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  38.75 
 
 
407 aa  226  6e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.13 
 
 
368 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  38.83 
 
 
368 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  37.43 
 
 
345 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  37.43 
 
 
345 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.75 
 
 
355 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.33 
 
 
375 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  38.83 
 
 
368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  38.83 
 
 
368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  38.83 
 
 
368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.83 
 
 
368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  38.83 
 
 
368 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  38.83 
 
 
368 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.41 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  36.87 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  34.76 
 
 
353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  36.79 
 
 
355 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  37.05 
 
 
353 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  34.73 
 
 
365 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.39 
 
 
355 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  36.49 
 
 
370 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  42.8 
 
 
354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  36.91 
 
 
362 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  37.42 
 
 
368 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.51 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  43.08 
 
 
401 aa  216  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  41 
 
 
386 aa  215  8e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.58 
 
 
368 aa  215  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  35.93 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  33.15 
 
 
374 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  42.26 
 
 
355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  33.89 
 
 
362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.35 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.19 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  37.1 
 
 
363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  43.46 
 
 
355 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.79 
 
 
351 aa  212  7.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  35.13 
 
 
347 aa  212  9e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  41.89 
 
 
355 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  41.92 
 
 
355 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  38.59 
 
 
374 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  36.77 
 
 
363 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  33.99 
 
 
381 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.66 
 
 
367 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.87 
 
 
372 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  43.35 
 
 
344 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.79 
 
 
342 aa  210  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  40.89 
 
 
355 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  42.05 
 
 
355 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  35.33 
 
 
350 aa  209  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  42.31 
 
 
355 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  35.31 
 
 
372 aa  209  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40.89 
 
 
355 aa  208  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  32.96 
 
 
357 aa  209  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  37.24 
 
 
354 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.78 
 
 
353 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  36.77 
 
 
363 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  35.31 
 
 
419 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  36.77 
 
 
363 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  35.14 
 
 
382 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  35.29 
 
 
362 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  35.31 
 
 
371 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  36.92 
 
 
383 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>