More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4181 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  84.33 
 
 		 136 aa  226  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  67.19 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  68.22 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  68.22 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  67.44 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  68.22 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  47.66 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  47.29 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  49.64 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  47.73 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  48.39 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  45.83 
 
 		 399 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  45.99 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  44.86 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  50.81 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  43.26 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  42.75 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 		 398 aa  78.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  46.73 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  46.73 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  32.5 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  45.35 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  36.04 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  38.3 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  35.07 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  35.14 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  49.25 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  37.84 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  49.25 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  49.21 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  35.71 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  49.21 
 
 		 315 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  50.79 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  33.06 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  47.76 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  32.59 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  32.59 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  30.37 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  37.84 
 
 		 313 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 		 473 aa  54.7  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  34.38 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  34.38 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  33.82 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  33.93 
 
 		 314 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  31.5 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  34.65 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  31.5 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  26.43 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.61 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2832  MutT/nudix family protein  38.75 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0990574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  38.79 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  32.33 
 
 		 325 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  32.79 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  34.02 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  39.71 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  33.61 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0265  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 200 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.306188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  37.27 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 334 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  33.82 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  28.36 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>