129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1297 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  100 
 
 
182 aa  362  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  57.79 
 
 
177 aa  167  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  57.52 
 
 
168 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  55.9 
 
 
337 aa  153  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 
152 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  49.32 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
145 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
147 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
143 aa  94.4  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
174 aa  90.9  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 
156 aa  87.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
145 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  37.8 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.86 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
177 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
160 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 
135 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1522  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
163 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  33.66 
 
 
118 aa  54.3  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
149 aa  54.3  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  36.03 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
137 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
164 aa  52  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
170 aa  51.2  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  30 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  32 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  29.23 
 
 
153 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 
153 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  31.2 
 
 
229 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
160 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  34.48 
 
 
212 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  42.11 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  33.33 
 
 
142 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1843  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
162 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  33.33 
 
 
141 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  31.78 
 
 
127 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  30.71 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  31.2 
 
 
153 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  31.2 
 
 
153 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  31.2 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  31.2 
 
 
153 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  46.51 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  31.2 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  31.2 
 
 
153 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  32.46 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
158 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  44.62 
 
 
459 aa  45.8  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.14 
 
 
176 aa  45.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
140 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
147 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
261 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  34.04 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  34.86 
 
 
289 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
139 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  34.04 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  34.04 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  34.04 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1495  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  29.73 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  36.67 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0122  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.151364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  30.39 
 
 
134 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  31.97 
 
 
314 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  34.88 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  32.81 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
281 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  46.51 
 
 
77 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  32.46 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.36 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  28.44 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02760  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 
248 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  64.52 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  31.86 
 
 
317 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  34.04 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
252 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  32.05 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>