213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 165 aa  322  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  65.62 
 
 		 161 aa  191  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  56.77 
 
 		 484 aa  189  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  58.18 
 
 		 475 aa  187  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  59.15 
 
 		 181 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  52.44 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  59.73 
 
 		 335 aa  151  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  52.56 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  53.69 
 
 		 305 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  47.68 
 
 		 291 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  47.74 
 
 		 299 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  44.74 
 
 		 287 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  47.17 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 292 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 		 234 aa  51.2  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  42.99 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  30.2 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  31.33 
 
 		 185 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  31.33 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  30.67 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  30.67 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  30.67 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  30.67 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  27.45 
 
 		 133 aa  47.8  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  30.67 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  30.67 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  31.25 
 
 		 383 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  32.14 
 
 		 314 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 240 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  46.81 
 
 		 319 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  42.86 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 209 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.11 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.13 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.93 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.35 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 196 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.15 
 
 		 396 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  25.19 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.51 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  31.67 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  31.94 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  31.94 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  28.43 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  32 
 
 		 322 aa  45.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 334 aa  45.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.04 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  29.7 
 
 		 384 aa  44.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 223 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  31.63 
 
 		 314 aa  44.3  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  28.43 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  30.97 
 
 		 130 aa  44.3  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 238 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 126 aa  44.3  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  28.43 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 229 aa  43.9  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  27.45 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  27.45 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  27.45 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 324 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  39.44 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>