254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2195 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  309  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 171 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 		 182 aa  94  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 177 aa  91.3  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  41.83 
 
 		 257 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 177 aa  84  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  40.94 
 
 		 337 aa  78.2  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  44.55 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  56.45 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  54.84 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  37.96 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  36.76 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  33.33 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  36.26 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  32.56 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  32.56 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  32.56 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.76 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  32.22 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  42.31 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  34.83 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.76 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  41.98 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  41.03 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  39.81 
 
 		 337 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 208 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  42.47 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  42.47 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  42.47 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  42.47 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 315 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.13 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  42.47 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  41.1 
 
 		 334 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  35.29 
 
 		 317 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  41.1 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  42.17 
 
 		 312 aa  47.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  27.07 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  38.2 
 
 		 314 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  34.69 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  32.65 
 
 		 363 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  32.08 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  37.36 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  27.83 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  27.83 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  29.81 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  32.08 
 
 		 229 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  29.57 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  32.84 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>