More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09350 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 337 aa  671    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  54.04 
 
 		 177 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  55.9 
 
 		 182 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  47.19 
 
 		 167 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  45.14 
 
 		 166 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  46.07 
 
 		 167 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 167 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  45.9 
 
 		 195 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.66 
 
 		 162 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  44 
 
 		 166 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  47.06 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  42.62 
 
 		 178 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 166 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  46.11 
 
 		 166 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 166 aa  126  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 		 152 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 161 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  42.2 
 
 		 171 aa  125  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  50.96 
 
 		 168 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  43.89 
 
 		 167 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  42.61 
 
 		 171 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  45.76 
 
 		 165 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  41.5 
 
 		 209 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  43.33 
 
 		 167 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  43.33 
 
 		 167 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  43.33 
 
 		 167 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  43.33 
 
 		 167 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  43.33 
 
 		 167 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  43.33 
 
 		 167 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  47.77 
 
 		 162 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 166 aa  122  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 		 195 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  44.52 
 
 		 169 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  40.44 
 
 		 178 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2043  dihydrofolate reductase  47.13 
 
 		 159 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0389  dihydrofolate reductase  48.41 
 
 		 159 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  41.11 
 
 		 166 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0847  dihydrofolate reductase  45.86 
 
 		 159 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  49.3 
 
 		 163 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2988  Dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.302882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 183 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  43.5 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 163 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  35.22 
 
 		 161 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  35.84 
 
 		 161 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  35.84 
 
 		 161 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  50.7 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  40.68 
 
 		 166 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 171 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 186 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  41.11 
 
 		 166 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  46.05 
 
 		 154 aa  115  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 165 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  41.78 
 
 		 170 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  44.83 
 
 		 172 aa  115  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  50.35 
 
 		 166 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  37.65 
 
 		 161 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 178 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 163 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  42.95 
 
 		 174 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  39.05 
 
 		 160 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 169 aa  113  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  42.37 
 
 		 169 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  44.16 
 
 		 166 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  41.77 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  43.36 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  41.81 
 
 		 173 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1681  Dihydrofolate reductase  42.05 
 
 		 181 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 179 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  41.25 
 
 		 163 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  37.87 
 
 		 160 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 		 160 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  35 
 
 		 163 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  39.44 
 
 		 164 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  40.98 
 
 		 167 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  37.87 
 
 		 160 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  42.48 
 
 		 172 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  40.25 
 
 		 164 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  41.48 
 
 		 198 aa  109  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 		 160 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  41.95 
 
 		 171 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  37.87 
 
 		 160 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 167 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  41.01 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  37.87 
 
 		 160 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 162 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  37.33 
 
 		 160 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  40.76 
 
 		 170 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  42.78 
 
 		 175 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  38.86 
 
 		 176 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  38.33 
 
 		 166 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>