267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1750 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  61.82 
 
 		 172 aa  219  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  61.82 
 
 		 172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  61.82 
 
 		 174 aa  216  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  56.21 
 
 		 172 aa  206  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  55.62 
 
 		 172 aa  204  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  60.12 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  56.73 
 
 		 173 aa  197  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  53.99 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  53.61 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  51.5 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  53.61 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 170 aa  168  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  52.47 
 
 		 166 aa  167  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  51.55 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  51.85 
 
 		 166 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  48.24 
 
 		 171 aa  164  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  52.15 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  51.55 
 
 		 166 aa  161  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 167 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  49.11 
 
 		 176 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  49.09 
 
 		 164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 		 166 aa  160  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  49.71 
 
 		 171 aa  160  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  51.22 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 163 aa  158  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  51.55 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  48.52 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  48.17 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 169 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 219 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  51.45 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  50.31 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 183 aa  154  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 163 aa  153  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  51.53 
 
 		 292 aa  153  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  49.67 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  43.56 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  43.5 
 
 		 173 aa  151  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  49.65 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  48.37 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 178 aa  150  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  51.55 
 
 		 180 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  42.24 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  48.68 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  46.11 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  46.11 
 
 		 170 aa  147  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  45.89 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  44.97 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  48.28 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  49.31 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  44.03 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 171 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  47.8 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>