268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2039 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 167 aa  340  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  55.06 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  54.43 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 163 aa  174  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  47.95 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  51.9 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  53.16 
 
 		 167 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  50.64 
 
 		 160 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  50.66 
 
 		 160 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  51.22 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  52.53 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  51.81 
 
 		 170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  50.61 
 
 		 170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  44.94 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  53.94 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  55.56 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  52.17 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 162 aa  163  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  52.8 
 
 		 166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  50.94 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 160 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  49.34 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  52.5 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 171 aa  160  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  50.61 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  51.85 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  51.53 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  48.68 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  54.55 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 		 172 aa  157  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  51.52 
 
 		 169 aa  157  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 219 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  51.55 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 161 aa  157  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  45.81 
 
 		 160 aa  157  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  40.25 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  46.45 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  46.79 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  51.2 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  48.68 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  49.11 
 
 		 172 aa  154  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 		 171 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 170 aa  154  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  49.11 
 
 		 209 aa  154  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 166 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 162 aa  154  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 162 aa  154  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 169 aa  154  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  41.25 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  47.43 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  45.39 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  49.64 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  50.97 
 
 		 180 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 160 aa  150  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  52.5 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 165 aa  150  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 259 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  45 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>