267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2773 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 166 aa  342  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  81.76 
 
 		 164 aa  278  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  73.91 
 
 		 164 aa  243  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  71.78 
 
 		 164 aa  237  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  68.71 
 
 		 166 aa  228  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  66.04 
 
 		 162 aa  221  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  65.41 
 
 		 164 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  64.46 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  64.2 
 
 		 165 aa  207  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  55 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  56.25 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  46.59 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  52.8 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  52.8 
 
 		 167 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  52.8 
 
 		 167 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  52.8 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  51.85 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  51.23 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  51.23 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  48.24 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  53.16 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  53.95 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  52.73 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  46.02 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 167 aa  153  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 167 aa  153  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 162 aa  153  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  47.88 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 166 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  53.19 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 		 163 aa  151  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 160 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  46.43 
 
 		 175 aa  150  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  47.53 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 194 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  49.7 
 
 		 178 aa  147  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  48.52 
 
 		 178 aa  147  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  53.01 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 163 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  50.67 
 
 		 259 aa  143  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  46.99 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  45.61 
 
 		 182 aa  140  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  48.17 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 160 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 176 aa  137  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  46.31 
 
 		 220 aa  136  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  48.92 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  40.25 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  46.41 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  47.3 
 
 		 172 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  49.34 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  38.96 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  46.75 
 
 		 176 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  43.12 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 209 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  46.78 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 170 aa  131  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>