267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2947 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  70.06 
 
 		 160 aa  227  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  55.97 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  51.33 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  54.49 
 
 		 306 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  51.33 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  52.76 
 
 		 164 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  52.15 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  55.8 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  53.21 
 
 		 306 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  57.97 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  58.59 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  55.07 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 167 aa  157  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  52.35 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  55.07 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  52.17 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 195 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  52.17 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  52.17 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  46.75 
 
 		 171 aa  153  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  53.75 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 162 aa  151  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  55.47 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  45.06 
 
 		 163 aa  150  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  57.81 
 
 		 160 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  55.04 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  50.97 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 		 172 aa  148  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  55.8 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  54.69 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  56.25 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  56.25 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  45.09 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  44.03 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  56.25 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 165 aa  143  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  44.91 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  49.37 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  46.81 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  47.17 
 
 		 167 aa  140  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 170 aa  140  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 292 aa  141  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  48.75 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  43.64 
 
 		 178 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 219 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  48.1 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 169 aa  136  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 196 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>