267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0817 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 167 aa  347  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  98.2 
 
 		 167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  92.81 
 
 		 167 aa  328  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  80.84 
 
 		 166 aa  283  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  78.44 
 
 		 166 aa  272  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  71.78 
 
 		 167 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  70.55 
 
 		 166 aa  236  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  72.39 
 
 		 219 aa  236  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  71.17 
 
 		 167 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  71.17 
 
 		 167 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  71.17 
 
 		 167 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  71.17 
 
 		 167 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  71.17 
 
 		 167 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  70.55 
 
 		 167 aa  233  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  73.01 
 
 		 166 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  71.78 
 
 		 209 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  72.39 
 
 		 195 aa  231  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  69.94 
 
 		 166 aa  231  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  71.17 
 
 		 166 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  68.71 
 
 		 166 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  70.55 
 
 		 166 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  69.94 
 
 		 166 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  69.94 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  56.96 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  54.43 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 161 aa  171  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  47.8 
 
 		 162 aa  170  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  53.16 
 
 		 162 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  47.8 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  54.94 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  50.94 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  47.8 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 161 aa  168  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 161 aa  168  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  52.8 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  51.53 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 169 aa  167  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  51.52 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  53.7 
 
 		 259 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  47.65 
 
 		 170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  48.1 
 
 		 160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  52.12 
 
 		 179 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  52.17 
 
 		 164 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  53.99 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  54.32 
 
 		 164 aa  160  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  48.75 
 
 		 163 aa  160  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  51.83 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  44.03 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 160 aa  158  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  49.37 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  47.47 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  48.5 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  47.74 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  48.78 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  49.03 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  46.29 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  46.78 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  46.45 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  52.41 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  49.69 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  45.28 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  47.4 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  43.02 
 
 		 173 aa  150  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 160 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  48.41 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>