267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0333 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 171 aa  350  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  87.06 
 
 		 171 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  88.24 
 
 		 171 aa  309  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  87.65 
 
 		 171 aa  307  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  77.91 
 
 		 170 aa  275  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  77.19 
 
 		 170 aa  268  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  76.61 
 
 		 170 aa  266  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  67.84 
 
 		 176 aa  237  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  69.88 
 
 		 168 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  63.91 
 
 		 171 aa  221  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  69.88 
 
 		 168 aa  207  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  54.14 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  48.81 
 
 		 195 aa  169  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  52.87 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 160 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  47.93 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  54.42 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  48.85 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  47.98 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 169 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 170 aa  154  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 160 aa  153  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  45.78 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  46.34 
 
 		 167 aa  150  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  47.77 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 163 aa  147  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  50.66 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  41.88 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 178 aa  143  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 167 aa  143  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  38.32 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  44.79 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  42.01 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  44.31 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  38.92 
 
 		 162 aa  141  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  46.51 
 
 		 219 aa  140  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  48.68 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  48.68 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  45.35 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  47.47 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 159 aa  137  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  44.1 
 
 		 163 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  45.35 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  44.77 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>