264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1259 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 166 aa  335  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  55.62 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  53.99 
 
 		 259 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  54.19 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  54.94 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 		 166 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  53.95 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  49.32 
 
 		 160 aa  154  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  48.19 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  47.3 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  49.32 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  51.9 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 		 166 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  52.03 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 167 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  51.9 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  49.32 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  51.9 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  46.11 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 186 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  47.97 
 
 		 160 aa  147  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  46.43 
 
 		 177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  46.5 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.6 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  45.95 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  45.81 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  38.89 
 
 		 162 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  39.61 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  47.31 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  39.61 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  48.52 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  49.01 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  55.91 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  38.96 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  38.96 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  38.96 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  38.96 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  38.96 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  38.96 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  38.96 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  51.8 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  49.68 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  47.31 
 
 		 209 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  44.59 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  43.71 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  38.31 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  47.68 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  48.59 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.14 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  46.62 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  40.35 
 
 		 170 aa  137  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  55.04 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 169 aa  137  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  45.16 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  46.99 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  47.47 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  47.8 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  45.22 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  48.37 
 
 		 163 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  53.28 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  53.28 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>