266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2858 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 165 aa  346  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  76.73 
 
 		 159 aa  263  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  75.47 
 
 		 159 aa  258  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  64.16 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  58.18 
 
 		 170 aa  200  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  55.28 
 
 		 163 aa  193  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  58.06 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  61.7 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  59.09 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  59.09 
 
 		 160 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  60.26 
 
 		 160 aa  184  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  64.96 
 
 		 160 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  60.26 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  64.23 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  52.5 
 
 		 162 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  61.54 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  64.62 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  60.14 
 
 		 160 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  63.85 
 
 		 160 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  54.66 
 
 		 160 aa  177  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  63.08 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  63.08 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  63.08 
 
 		 160 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  54.66 
 
 		 165 aa  173  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  56.97 
 
 		 167 aa  173  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  52.87 
 
 		 160 aa  171  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  51.23 
 
 		 175 aa  170  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  55.28 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  53.42 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 171 aa  167  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  51.88 
 
 		 159 aa  167  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  51.25 
 
 		 196 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  52.5 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  51.25 
 
 		 196 aa  165  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  52.5 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  52.5 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  52.5 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  52.5 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  51.25 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  51.25 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  51.25 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  51.25 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  51.25 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  51.25 
 
 		 196 aa  164  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 172 aa  163  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  51.19 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  47.8 
 
 		 166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 163 aa  160  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 		 169 aa  160  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  48.81 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  158  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  50.94 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  51.55 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  51.55 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 170 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  157  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 195 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  46.54 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>