267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0899 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  53.05 
 
 		 163 aa  184  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  52.98 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  54.37 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  53.89 
 
 		 171 aa  174  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 172 aa  173  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 161 aa  171  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 161 aa  171  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 171 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 		 176 aa  167  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  48.41 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  52.87 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  46.88 
 
 		 161 aa  165  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  50.89 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 162 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  51.57 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 169 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 196 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 196 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 172 aa  160  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  52.55 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  44.69 
 
 		 183 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  52.55 
 
 		 160 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  48.41 
 
 		 160 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  50.36 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  51.22 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  44.94 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  51.82 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  48.81 
 
 		 170 aa  158  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 159 aa  158  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  51.09 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  51.09 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  49.4 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  51.09 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  48.5 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  51.09 
 
 		 160 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  49.68 
 
 		 160 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 162 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  53.21 
 
 		 160 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 166 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  46.58 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 162 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  47.77 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 		 170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 171 aa  151  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  46.71 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  48.75 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  45.61 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  45.4 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>