267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2449 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  100 
 
 
169 aa  344  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  58.64 
 
 
171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  57.41 
 
 
173 aa  177  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
170 aa  174  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  53.89 
 
 
166 aa  173  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  55.15 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  53.29 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 
174 aa  171  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  48.81 
 
 
171 aa  169  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  54.14 
 
 
180 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  53.94 
 
 
167 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  53.33 
 
 
167 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  50 
 
 
172 aa  167  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  51.5 
 
 
170 aa  167  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 
179 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 
166 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  53.33 
 
 
167 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
170 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 
170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
162 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  51.5 
 
 
170 aa  164  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  50.89 
 
 
176 aa  164  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  53.01 
 
 
167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  53.94 
 
 
219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  50 
 
 
178 aa  163  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  48.54 
 
 
171 aa  163  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  49.7 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  52.69 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  52.1 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  52.41 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  52.41 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  52.41 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  52.41 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  54.55 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  52.41 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
178 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  52.12 
 
 
166 aa  161  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  54.55 
 
 
166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  46.43 
 
 
163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  53.61 
 
 
209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  54.55 
 
 
166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  52.1 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  51.52 
 
 
166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  51.5 
 
 
166 aa  160  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  51.81 
 
 
167 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  54.55 
 
 
195 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  53.94 
 
 
166 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  53.94 
 
 
186 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  47.93 
 
 
171 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
171 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  48.81 
 
 
165 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  49.11 
 
 
171 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
171 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  52.73 
 
 
166 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 
169 aa  159  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  52.66 
 
 
163 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  56.08 
 
 
168 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  51.52 
 
 
167 aa  157  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  51.2 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  50 
 
 
167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  47.31 
 
 
163 aa  154  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
172 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 
175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
172 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  48.19 
 
 
163 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  45.51 
 
 
164 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
162 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 
162 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 
162 aa  148  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 
162 aa  148  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 
162 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 
162 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 
162 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  44.64 
 
 
167 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  45.51 
 
 
159 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  55.41 
 
 
168 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 
162 aa  148  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 
159 aa  147  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 
162 aa  147  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 
162 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  41.07 
 
 
162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 
162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  43.71 
 
 
161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 
164 aa  143  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  47.37 
 
 
164 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 
160 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 
165 aa  143  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  45.83 
 
 
177 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 
183 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 
195 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 
160 aa  141  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  42.42 
 
 
161 aa  140  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 
165 aa  140  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  47.65 
 
 
165 aa  140  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  45.29 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>