267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0096 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  100 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  65.61 
 
 
171 aa  211  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  48.12 
 
 
177 aa  167  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  53.7 
 
 
188 aa  167  8e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
162 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  53.09 
 
 
166 aa  163  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  47.53 
 
 
163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 
163 aa  160  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  52.8 
 
 
172 aa  159  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  51.53 
 
 
167 aa  159  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
169 aa  159  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 
165 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  53.12 
 
 
166 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 
164 aa  158  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 
160 aa  158  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 
171 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  49.08 
 
 
163 aa  157  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 
161 aa  156  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 
160 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 
161 aa  156  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
160 aa  154  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
165 aa  153  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 
160 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 
160 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  53.75 
 
 
161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  48.43 
 
 
162 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  53.28 
 
 
160 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 
166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  48.45 
 
 
160 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 
160 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  42.41 
 
 
161 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 
160 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 
172 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 
160 aa  148  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 
176 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  54.55 
 
 
160 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
163 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  48.48 
 
 
171 aa  148  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  44.79 
 
 
183 aa  147  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 
166 aa  147  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  40 
 
 
162 aa  146  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 
172 aa  146  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  46.41 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  41.76 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  51.85 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 
160 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  47.93 
 
 
195 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
160 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 
159 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  41.98 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  45.28 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  50.94 
 
 
163 aa  143  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  46.99 
 
 
179 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 
160 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 
160 aa  143  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 
160 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 
166 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 
166 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  40.99 
 
 
161 aa  141  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  40 
 
 
162 aa  141  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
292 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 
159 aa  140  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  46.54 
 
 
196 aa  140  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  46.54 
 
 
159 aa  140  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
162 aa  140  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 
165 aa  140  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 
196 aa  140  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 
159 aa  140  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 
159 aa  140  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 
159 aa  140  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
159 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
159 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
159 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
159 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
159 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  44.65 
 
 
167 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 
179 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  39.64 
 
 
171 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 
174 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2031  Dihydrofolate reductase  55.64 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00277782  hitchhiker  0.0000505034 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  44.52 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  44.03 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
162 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  51.88 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 
166 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  39.75 
 
 
164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>