267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0487 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 164 aa  338  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  60.62 
 
 		 160 aa  204  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  61.78 
 
 		 160 aa  197  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  49.68 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 164 aa  151  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  41.51 
 
 		 162 aa  141  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  42.77 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  46.45 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  46.45 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  44.52 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  44.03 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0378  dihydrofolate reductase FolA  44.65 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  41.07 
 
 		 171 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 172 aa  131  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  45.75 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 171 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  42.58 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  43.14 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  46.75 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  44.23 
 
 		 175 aa  130  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  41.94 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  43.51 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  45.52 
 
 		 176 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  39.39 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  42.6 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  38.99 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 188 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  38.36 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 162 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  41.25 
 
 		 166 aa  123  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  41.94 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  44.83 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  39.88 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  39.62 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 292 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  40.88 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1653  Dihydrofolate reductase  42.04 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  40.88 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  46.21 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  43.38 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  41.25 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  43.38 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  47.33 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  38.71 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  39.31 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  40.26 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  42.95 
 
 		 194 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  41.91 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  44 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>