270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2061 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 162 aa  336  9e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  53.75 
 
 		 161 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  47.06 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  47.2 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  44.97 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  43.14 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  42.48 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  43.86 
 
 		 171 aa  130  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  43.84 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  51.75 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  44.37 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  44.37 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  43.95 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  42.14 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  43.14 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  46.1 
 
 		 259 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  39.1 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0378  dihydrofolate reductase FolA  39.74 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  43.95 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  43.14 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  44.9 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  45.07 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  39.62 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  45.14 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  42.76 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  40.37 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  40.36 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  43.14 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  38.89 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  41.45 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  44.2 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  41.36 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  45.65 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  41.45 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  45.22 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  44.14 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  44.2 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  40.51 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  43.92 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4255  Dihydrofolate reductase  38.89 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  40.88 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  41.45 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  38.06 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  42.66 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  43.26 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  42.55 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  45.07 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  43.92 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  41.45 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  42.75 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  42.48 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  42.48 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  41.45 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2167  dihydrofolate reductase region  42.58 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  41.45 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  44.22 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>