267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0579 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  51.23 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  52.8 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 164 aa  163  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 166 aa  163  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 		 164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  50.61 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  50.61 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  48.78 
 
 		 167 aa  154  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 160 aa  154  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  49.09 
 
 		 176 aa  153  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 165 aa  153  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  44.79 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  44.79 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 259 aa  150  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 292 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 164 aa  147  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 164 aa  147  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 171 aa  142  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  45.03 
 
 		 195 aa  141  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  47.83 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  56.06 
 
 		 168 aa  140  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  44.79 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 167 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  43.53 
 
 		 172 aa  140  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  48.03 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  43.53 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  43.86 
 
 		 170 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 162 aa  137  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  50.34 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 178 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  44.24 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  47.31 
 
 		 177 aa  134  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  44.83 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  45.61 
 
 		 178 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 175 aa  134  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  39.53 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  43.98 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 219 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 169 aa  133  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  50.34 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 169 aa  132  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  39.38 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>