271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0341 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 177 aa  353  5e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  50.91 
 
 		 292 aa  144  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  45.16 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  51.11 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  56.2 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 169 aa  137  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  48.53 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  44.31 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  49.41 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  47.31 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  48.82 
 
 		 166 aa  134  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 160 aa  134  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  43.53 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  41.29 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  48.24 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 161 aa  131  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  42.08 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2988  Dihydrofolate reductase  43.86 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.302882  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  48.54 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  47.37 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  45.56 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  43.71 
 
 		 162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  42.24 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 177 aa  127  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  39.08 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  46.24 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  41.77 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  37.8 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  37.8 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  46.47 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 159 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 195 aa  124  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  44.19 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  42.77 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2167  dihydrofolate reductase region  45.71 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  40.48 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  42.58 
 
 		 164 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  42.6 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  43.6 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  42.01 
 
 		 164 aa  121  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  38.32 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  42.6 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  40.94 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  42.53 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  41.76 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  43.58 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1681  Dihydrofolate reductase  42.01 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  49.26 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  40.94 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  42.6 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  41.45 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  42.69 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>